Засновником та вищим органом управління ПЗВО «ТЕРНОПІЛЬСЬКА БОГОСЛОВСЬКА АКАДЕМІЯ ІМЕНІ ПАТРІАРХА ЙОСИФА СЛІПОГО» є РЕЛІГІЙНА ОРГАНІЗАЦІЯ «ТЕРНОПІЛЬСЬКО-ЗБОРІВСЬКА АРХИЄПАРХІЯ УКРАЇНСЬКОЇ ГРЕКО-КАТОЛИЦЬКОЇ ЦЕРКВИ» в особі Архиєпископа і Митрополита Тернопільсько-Зборівської архиєпархії УГКЦ.
Засновник Академії:
- затверджує Статут Академії, вносить до нього зміни та затверджує нову редакцію;
- організовує ліцензування Академії; - своїм рішенням (через Наказ чи Декрет) призначає та звільняє з посади ректора Академії;
- укладає в місячний строк контракт з ректором Академії;
- створює Сенат (Наглядову Раду) Академії;
- призначає склад Сенату (Наглядову Раду) Академії;
- приймає рішення про реорганізацію або ліквідацію Академії;
- приймає рішення про заснування Академією інших юридичних осіб;
- погоджує рішення Вченої ради Академії про створення факультетів та кафедр;
- має право скасувати будь-яке рішення чи розпорядження ректора, якщо його прийнято з порушенням законодавства чи Статуту Академії або, якщо воно суперечить моральним чи світоглядним засадам діяльності Академії;
- здійснює інші повноваження, передбачені законодавством і Статутом Академії.